Jogoro Kobato vorrebbe vivere una vita normale e tranquilla in seguito ad una brutta esperienza. Lui e Yuki Osanai si legano in una relazione di reciproco interesse siccome anche Yuki nutre lo stesso desiderio di serenità. Iniziano quindi la scuola superiore insieme, impegnandosi per vivere i loro giorni studenteschi come persone qualunque, ma sfortunatamente continuano ad imbattersi in incidenti e misteri.