La storia si ambienta in un epoca imprecisata in cui l'umanità ha subito l'attacco dello "shinobi", oscuro "veleno" portato sulla Terra dalla caduta di un asteroide; ultimo rifugio sicuro del genere umano è "Kariku", un enclave situata sul fondo degli abissi marini. Una luce di speranza potrebbe però dare all'umanità una possibilità di riscatto: la "Sacra Arma Giga Road" e il leggendario guerriero maledetto Yagyuu; la principessa Ame, nobile di una nazione decaduta decisa ad affrontare la minaccia e salvare il mondo.