mbientata tra la quinta e la sesta stagione della serie principale, Rick and Morty: The Anime ruota attorno alle avventure di versioni alternative dei membri della famiglia Smith: lo scienziato pazzo Rick Sanchez e i suoi nipoti, il quattordicenne Morty e la diciassettenne Summer e i loro genitori Jerry e Beth (la figlia di Rick). Mentre Morty incontra la "guerriera del tempo" Elle, una trama parallela esplora gli ultimi mesi di vita di Jerry Prime.