"Come sono stati creati i Gaia Memories?" e "Perché W ha iniziato a combattere?" Per rispondere alle domande di Tokime, Shōtarō inizia a raccontare la sua storia. Persone misteriose chiamate Dopants, che utilizzavano i poteri dei Gaia Memories, avevano iniziato ad apparire nelle ombre della città di Fuuto. Un giovane Shōtarō era diventato assistente del detective Sokichi e, sebbene poco esperto, aveva iniziato a seguire le sue orme. Ignaro del fatto che, oltre al suo lavoro da detective, Sokichi stava segretamente agendo come Skull, il ragazzo iniziò a sentirsi frustrato con il suo mentore. Fu allora che la Narumi Detective Agency ricevette una telefonata, una richiesta dall'Inferno che invitava Shōtarō e compagnia in una missione misteriosa...