Steins;Gate parla di un gruppo di amici che hanno sviluppato un oggetto in grado di inviare messaggi nel passato. Mentre effettuano esperimenti su questo fenomeno, vengono rintracciati da un?organizzazione di nome SERN, che a sua volta stava effettuando ricerche nel campo dei viaggi nel tempo. I protagonisti devono ora trovare un modo per evitare di essere catturati dai loro inseguitori.