La storia si svolge in un futuro prossimo in un mondo nato dall'immaginazione umana. Ciò che gli umani chiamavano fantasmi o mostri appaiono: sono i "phantom". Il protagonista, Haruhiko Ichijō, è uno studente al primo anno della Hosea Academy. Qui ci sono anche la senpai Mai Kawakami, che combatte i phantom con la sua abilità "Spirito dei cinque elementi", Izumi Reina, con l’abilità "Mangia Phantom" e Koito Minase, che li combatte in solitudine. I giovani sperimentano gli alti e i bassi della vita scolastica fin quando un certo incidente non li porterà a conoscenza delle verità dietro il loro mondo.