In natura esistono i mushi, strane creature simili ad insetti invisibili alla maggior parte degli uomini, entità legate alla vita e alla natura in modo più profondo rispetto all'uomo, in grado di alterare, anche profondamente, la vita di tutte le creature con cui vengono a contatto. Ginko è un mushishi, un uomo in grado di vedere i mushi, che viaggia per tutto il Giappone senza fissa dimora; suo compito è risolvere i più disparati problemi causati dai mushi agli esseri umani. Ogni episodio è una nuova storia, un nuovo mushi di cui esplorare storia, natura ed effetti, una nuova situazione di cui indagare personaggi, caratterizzazioni psicologiche, situazione sociale ed economica.