La storia, a tinte soprannaturali, ruota attorno a Harutora Tsuchimikado, un liceale discendente da una famiglia di onmyouji - degli spiritualisti giapponesi dediti alla magia e a pratiche esoteriche, talvolta assimilati agli sciamani - che però non ha alcun potere particolare. Il ritorno in città di Natsume, sua amica d'infanzia e prossima erede alla guida della famiglia, scombussolerà non poco la sua vita quotidiana'