La storia seguirà le vicende vissute da uno studente di nome Suzuhara Sorata, il quale viene trasportato in un mondo diverso e alternativo, un mondo che ricorda un misto fra l’epoca Meiji e quella Taisho. In questo strano luogo, il nostro protagonista si unisce ad un gruppo formato da 3 ragazze e 9 ragazzi, per fare un viaggio a bordo della Norn, una nave misteriosa, contenente una mini-città ed in grado di navigare in cielo. Come si evolverà la situazione?