Sentan, un'isola lussureggiante e tranquilla, resta imparziale ed estranea alla guerra in corso tra il governo del Nord e quello del Sud. Un giorno Akiyuki Takehara, comune studente risiedente sull'isola insieme a sua madre Fusa, si reca a scuola come al solito, ma finisce coinvolto in un'esplosione, insieme ai suoi amici Haru e Furuichi. L'esplosione, detonata da una ragazza dai capelli bianchi che era salita sull'autobus scolastico, produce una luce misteriosa, che si va impiantare nel braccio di Akiyuki, causandogli un dolore straziante e trasformandolo in un mostro dai poteri sconosciuti chiamato Xam'd. Una strana ragazza con dei tatuaggi sul volto lo porterà in soccorso e gli insegnerà a controllare l'essere nel suo braccio chiamato Hiruko.