Baki è annoiato. Dopo la conclusione della battaglia epica tra padre e figlio, lui continua a fare combattimenti underground e ad allenarsi senza fermarsi, ma deve sempre reprimere il suo sbadiglio causato dalla noia. Nessuno stimolo o pericolo può portare eccitazione in lui in questo momento. Ora, con l'inclusione del Primo Ministro Giapponese nel circuito, un grande progetto di clonazione di massa sta provando a clonare Miyamoto Musashi, uno dei padri delle arti marziali in Giappone. Un'altra battaglia di proporzioni epiche attende Baki!