La serie è ambientato in un Far West alternativo con elementi fantascientifici. Segue le avventure di Tochiro Oyama e Harlock mentre cercano di raggiungere la misteriosa Gun Frontier, una località leggendaria che offre una via di fuga dalla Terra. Lungo il cammino, affrontano sfide, nemici e misteri, mantenendo sempre viva la speranza di raggiungere il loro obiettivo.