Vinta la guerra contro i mostri meccanici del dottor Hell, Koji Kabuto si gode il meritato riposo, ma una nuova minaccia, annunciata da un misterioso profeta, incombe sull'umanità: le Sette Armate del malvagio Generale delle Tenebre sono ormai pronte a riemergere dalle viscere della Terra per riprenderne possesso. Improvvisamente, le maggiori capitali del mondo subiscono l'irresistibile attacco di potenti mostri guerrieri, che seminano ovunque distruzione e morte. A Tokyo Koji riesce a sconfiggerli, ma Mazinger Z esce notevolmente danneggiato dallo scontro. Inoltre, durante l'attacco che non risparmia l'Istituto di Ricerca sull'Energia Fotoatomica, il fratellino Shiro Kabuto rimane gravemente ferito e solo una trasfusione di sangue di Koji riesce a salvargli la vita. Quando i mostri guerrieri tornano all'attacco più in forze di prima, sia Mazinger Z che Koji non sono ancora in condizioni di combattere e l'esito dello scontro appare ormai scontato. Ciò nonostante, Koji parte con un Mazinger Z ancora seriamente danneggiato, riesce a farsi valere ma i nemici sono troppo numerosi e forti. Koji ha velocemente la peggio nonostante l'aiuto in extremis di Sayaka e di Boss, che collega Boss Robot a due missili: i mostri infatti si sbarazzano in fretta sia di lui che di Sayaka con la sua Diana A, e sembra che per Koji e per Mazinger Z sia giunta la fine. Ma dalle fiamme di un vulcano emerge in loro soccorso un misterioso robot costruito a immagine e somiglianza di Mazinger Z, evocato dal profeta dell'inizio che si rivela essere il dottor Kenzo Kabuto, padre di Koji: è il Great Mazinger guidato da Tetsuya Tsurugi. Il robot, con un modulo jet retrattile incorporato, raggiunge subito il campo di battaglia e aiuta Koji a sbarazzarsi dei mostri guerrieri, dimostrando a tutti di essere molto più forte, resistente e comunque, sotto tutti i punti di vista, nettamente superiore in prestazioni a Mazinger Z. Koji e Tetsuya condividono una breve conversazione in cui Tetsuya gli dice che il suo robot è il fratello di Mazinger Z, concepito proprio per sconfiggere il nuovo nemico, le Sette Armate di Mikene, quindi se ne va, lasciando Koji a chiedersi chi potrebbe aver costruito un simile robot.