Da Capo 2 viene ambientato a una distanza di due anni dal termine delle vicende che avevano contraddistinto la prima serie. Junichi, lasciato solo da Nemu, partita per motivi di studio, viene supportato in questi due anni da tutte le altre ragazze che conosciute in precedenza, le quali, a turno, gli preparano da mangiare, gli puliscono casa, gli stirano la biancheria e, ovviamente, si innamorano di lui. A rendere ancora più movimentata la vita di Junichi ci sarà anche un nuovo personaggio, Ashia, scesa in Giappone dalla Scandinavia per imparare la magia dalla nonna di Junichi; e ovviamente, si aspetta il ritorno di Nemu, che non dovrebbe tardare troppo.