Prequel della prima serie, Shinkyoku Soukai Polyphonica Crimson S concentra la sua attenzione sempre su Corticarte e Pharon ma stavolta racconta le loro avventure durante gli anni dell'accademia. In particolare viene raccontato il primo incontro fra i due, avvenuto quando Pharon era solo un giovane aspirante "Dantista". I due finiranno per diventare partner ed insieme si adopereranno per risolvere i problemi che nasceranno fra spiriti ed umani.